Ctrl+K
Logo image Logo image

Site Navigation

  • Installation
  • HTMD
  • Moleculekit
  • ACEMD
  • PlayMolecule Installation
  • PM-API
  • JobQueues
  • Help
  • Internal Docs
  • Acellera

Site Navigation

  • Installation
  • HTMD
  • Moleculekit
  • ACEMD
  • PlayMolecule Installation
  • PM-API
  • JobQueues
  • Help
  • Internal Docs
  • Acellera

Section Navigation

  • htmd.adaptive package
    • htmd.adaptive.adaptive module
    • htmd.adaptive.adaptivebandit module
    • htmd.adaptive.adaptivegoal module
    • htmd.adaptive.adaptivegoaleg module
    • htmd.adaptive.adaptiverun module
    • htmd.adaptive.util module
  • htmd.builder package
    • htmd.builder.amber module
    • htmd.builder.builder module
    • htmd.builder.charmm module
    • htmd.builder.ionize module
    • htmd.builder.loopmodeler module
    • htmd.builder.noncanonical module
    • htmd.builder.solvate module
  • htmd.clustering package
    • htmd.clustering.kcenters module
    • htmd.clustering.regular module
  • htmd.mdengine package
    • htmd.mdengine.acemd package
      • htmd.mdengine.acemd.acemd module
  • htmd.membranebuilder package
    • htmd.membranebuilder.build_membrane module
    • htmd.membranebuilder.globalminimization module
    • htmd.membranebuilder.ljfluid module
    • htmd.membranebuilder.pdbreporter module
    • htmd.membranebuilder.ringpenetration module
    • htmd.membranebuilder.simulate_openmm module
  • htmd.molecule package
    • htmd.molecule.molecule module
    • htmd.molecule.util module
  • htmd.projections package
    • htmd.projections.gwpca module
    • htmd.projections.kmeanstri module
    • htmd.projections.metric module
    • htmd.projections.metriccoordinate module
    • htmd.projections.metricdihedral module
    • htmd.projections.metricdistance module
    • htmd.projections.metricfluctuation module
    • htmd.projections.metricplumed2 module
    • htmd.projections.metricrmsd module
    • htmd.projections.metricsasa module
    • htmd.projections.metricsecondarystructure module
    • htmd.projections.metricshell module
    • htmd.projections.metricsphericalcoordinate module
    • htmd.projections.metrictmscore module
    • htmd.projections.tica module
  • htmd.protocols package
    • htmd.protocols.equilibration_v3 module
    • htmd.protocols.production_v6 module
  • htmd.queues package
    • htmd.queues.localqueue module
    • htmd.queues.lsfqueue module
    • htmd.queues.pbsqueue module
    • htmd.queues.playqueue module
    • htmd.queues.simqueue module
    • htmd.queues.slurmqueue module
  • htmd.config module
  • htmd.decorators module
  • htmd.dock module
  • htmd.home module
  • htmd.kinetics module
  • htmd.latest module
  • htmd.license module
  • htmd.metricdata module
  • htmd.metricdatagenerator module
  • htmd.model module
  • htmd.mutualinformation module
  • htmd.parallelprogress module
  • htmd.pathplanning module
  • htmd.session module
  • htmd.simlist module
  • htmd.ui module
  • htmd.units module
  • htmd.util module
  • htmd.version module
  • htmd.versionwarnings module

htmd.clustering package#

Submodules#

  • htmd.clustering.kcenters module
  • htmd.clustering.regular module

Module contents#

previous

htmd.builder.noncanonical module

next

htmd.membranebuilder package
On this page
  • Submodules
  • Module contents

© Copyright 2023.