moleculekit.pdbx.reader package

Submodules

• moleculekit.pdbx.reader.BinaryCifReader module
  • BinaryCifDecoders
    • BinaryCifDecoders.bCifCodeTypeD
    • BinaryCifDecoders.bCifTypeD
    • BinaryCifDecoders.byteArrayDecoder()
    • BinaryCifDecoders.decode()
    • BinaryCifDecoders.deltaDecoder()
    • BinaryCifDecoders.fixedPointDecoder()
    • BinaryCifDecoders.integerPackingDecoder()
    • BinaryCifDecoders.intervalQuantizationDecoder()
    • BinaryCifDecoders.runLengthDecoder()
    • BinaryCifDecoders.stringArrayDecoder()
  • BinaryCifReader
    • BinaryCifReader.deserialize()
• moleculekit.pdbx.reader.PdbxContainers module
  • CifName
    • CifName.attributePart()
    • CifName.categoryPart()
  • ContainerBase
    • ContainerBase.append()
    • ContainerBase.exists()
    • ContainerBase.getName()
    • ContainerBase.getObj()
    • ContainerBase.getObjNameList()
    • ContainerBase.getType()
    • ContainerBase.printIt()
    • ContainerBase.remove()
    • ContainerBase.rename()
    • ContainerBase.replace()
    • ContainerBase.setName()
    • ContainerBase.setType()
  • DataCategory
    • DataCategory.__getitem__()
    • DataCategory.append()
    • DataCategory.appendAttribute()
    • DataCategory.appendAttributeExtendRows()
    • DataCategory.dumpIt()
    • DataCategory.getAttributeCount()
    • DataCategory.getAttributeIndex()
    • DataCategory.getAttributeLengthMaximumList()
    • DataCategory.getAttributeList()
    • DataCategory.getAttributeListWithOrder()
    • DataCategory.getAttributeValueMaxLengthList()
    • DataCategory.getCurrentAttribute()
    • DataCategory.getFormatTypeList()
    • DataCategory.getFormatTypeListX()
    • DataCategory.getFullRow()
    • DataCategory.getIndex()
    • DataCategory.getItemNameList()
    • DataCategory.getName()
    • DataCategory.getRow()
    • DataCategory.getRowCount()
    • DataCategory.getRowIndex()
    • DataCategory.getRowList()
    • DataCategory.getValue()
    • DataCategory.getValueFormatted()
    • DataCategory.getValueFormattedByIndex()
    • DataCategory.hasAttribute()
    • DataCategory.invokeAttributeMethod()
    • DataCategory.invokeCategoryMethod()
    • DataCategory.printIt()
    • DataCategory.removeRow()
    • DataCategory.renameAttribute()
    • DataCategory.replaceSubstring()
    • DataCategory.replaceValue()
    • DataCategory.setValue()
  • DataCategoryBase
    • DataCategoryBase.get()
    • DataCategoryBase.setAttributeNameList()
    • DataCategoryBase.setName()
    • DataCategoryBase.setRowList()
  • DataContainer
    • DataContainer.getGlobal()
    • DataContainer.invokeDataBlockMethod()
    • DataContainer.setGlobal()
  • DefinitionContainer
    • DefinitionContainer.isAttribute()
    • DefinitionContainer.isCategory()
    • DefinitionContainer.printIt()
• moleculekit.pdbx.reader.PdbxParser module
  • PdbxError
  • PdbxReader
    • PdbxReader.read()
  • PdbxWriter
    • PdbxWriter.write()
    • PdbxWriter.writeContainer()
  • SyntaxError
• moleculekit.pdbx.reader.PdbxReader module
  • PdbxError
  • PdbxReader
    • PdbxReader.read()
  • SyntaxError

Module contents